公司发工资违法与否，特殊情况或例外情形可能影响判断，具体如下：
1、双方书面协议约定非标准支付方式：若员工与公司在劳动合同中明确约定工资以特定非货币形式（如部分工资以公司产品抵扣，但需符合等价交换原则且不违反强制性规定）或非按月支付（如项目完工后一次性支付，但需双方同意且不影响员工基本生活），且协议内容不违反法律强制性规定，可能不认定为违法。但需注意，此类协议需双方自愿签订，且不得排除劳动者主要权利，否则仍可能因违法而无效。
2、员工因故委托他人代领工资：根据《工资支付暂行规定》第六条，劳动者本人因故不能领取工资时，可由其亲属或委托他人代领。此时公司将工资支付给代领人，不属于违法，但公司需核实代领人身份及委托手续，确保工资支付给合法权利人，否则可能因支付对象错误引发纠纷。
3、疫情等不可抗力导致工资延迟支付：若因疫情等不可抗力因素，公司无法按时支付工资，且在不可抗力消除后及时支付并向员工说明情况，根据《工资支付暂行规定》等相关规定，可能不认定为“无故拖欠”工资的违法行为。但公司需提供不可抗力证明材料，并与员工协商一致延迟支付期限。
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公司发工资违法，可能给员工带来多方面法律风险，以下举例说明：
1、经济损失风险：若公司未依法代扣代缴个人所得税，员工可能面临补税、罚款甚至刑事责任。例如，员工小王每月税前工资15000元，公司未代扣个税，小王也未自行申报，税务机关检查后，小王需补缴税款并可能被处以罚款，造成经济损失。
2、证据链风险：若公司以现金形式发放工资且未书面记录支付明细，员工可能因缺乏完整证据无法证明工资支付情况，影响工资追讨。例如，小李所在公司长期现金发工资且不提供工资条，后公司拖欠其3个月工资，小李申请劳动仲裁时，因无法提供工资条、银行流水等直接证据证明工资标准和欠薪事实，仲裁请求难以得到支持。
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公司发工资是否违法，需结合具体支付方式、个税代扣代缴等情况综合判断，以下从不同情形分析：
若公司未以货币形式按月支付工资，例如长期以实物抵扣或无故拖欠工资，可能违反《劳动法》第五十条“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资”的规定。若公司通过现金发放工资但未书面记录支付明细（如工资数额、时间、领取人签字）并保存两年以上，或未向员工提供个人工资清单，则违反《工资支付暂行规定》第六条关于工资支付记录及工资条的要求。若公司作为扣缴义务人未依法为员工代扣代缴个人所得税，即工资条显示有个税代扣但个税申报记录中无对应申报金额，或未代扣个税导致员工未依法纳税，则违反《中华人民共和国个人所得税法》第九条“支付所得的单位或者个人为扣缴义务人”的规定。
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面对公司发工资违法问题，部分员工错误操作可能影响维权效果，常见错误行为如下：
1、忽视工资条等证据的保存：部分员工未养成保存工资条、银行流水的习惯，或收到工资条后随意丢弃。后续发现公司发工资违法时，因无法提供关键证据证明工资支付方式、金额、个税代扣等情况，维权主张可能难以成立。
2、拖延维权时间：劳动争议申请仲裁的时效为一年，若员工明知公司发工资违法（如拖欠工资、未提供工资条）却长期未采取投诉、仲裁等措施，可能因超过时效丧失胜诉权；税务违法行为追诉期一般为五年，个税代扣问题若未及时举报，也可能因超过时效难以追回损失。
3、与公司冲突时采取过激行为：部分员工在沟通工资问题时情绪激动，采取旷工、破坏公司财物等过激行为，不仅无法解决问题，还可能因违反公司规章制度被处罚，甚至影响后续维权正当性。若你已出现类似错误操作或不确定如何正确维权，建议尽快联系我，我会为你提供专业解答，避免权益进一步受损。

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